可王允竟露出冷嘲的颜色，当众批评道：“若当真是皇甫义真的遗泽，我哪里还敢起兵诛杀董贼呢？尔等可知道，我为除去董卓夙兴夜寐，可皇甫义真坏了我多少大事！”
于是司徒将自己这三年来，与皇甫嵩的往来一一陈述，说到皇甫嵩数次拒绝时，他言辞激烈，显然对此耿耿于怀。而后更将自己陷害皇甫嵩与诛杀董卓的计划细节公之于众。
他说完，朝会众臣鸦雀无声。
沉默了好一会，五官中郎将蔡邕走上殿中，哀声前道：“君子为人处事，当光明正大，而百官身居高位，更当做天下之楷模。司徒于非常之时行非常之事，除暴戾，兴忠孝，天下之人无不钦佩，都是因为司徒心怀社稷。但如今大业方兴未艾，正是要给天下显示品德的时候，司徒如何能以申白之术乱天下人心呢？还请司徒慎言啊！”
他本欲再说多些，说大臣之间如此中伤构陷，太过影响军心士气。凉人原本颇受皇甫嵩之死影响，都以为是董卓昏庸滥杀，故而士气随之低落；可如今司徒自己将这些公之于众，他们便会认定是朝堂黑暗，士人欺辱太师，继而同仇敌忾，导致大义之名反在叛逆手中。
可他直视王允那熊熊烈火般的眼神，终究将这些话咽下去了。
但这些话蔡邕不说，王允也能明白他想说什么，他拍着桌案，冷然道：“蔡公如此言语，是说董卓与皇甫嵩罪不当诛吗？”
蔡邕还欲分辩，王允一声断喝：“够了！”朝中百官都是一抖，众人惊愕间，他急声骂道：“董卓猖狂，就是你这样的人太多！我每日出入幕府，见尔等借着董卓的威风登上高位，尸位素餐，不思报国，反而助纣为虐。竟到现在还不悔改，尔等莫非以为，吾之刀剑不如董卓之快？”
说罢，他当即呼唤宫中侍卫，下令将蔡邕关入诏狱。这一切发生得太快，剩下那些本来还想劝谏一番的大臣们，如今也不敢言语，就转而注视着蔡邕。蔡邕年岁已大，发髻已是半白，身体也较为虚弱，如今戴上镣铐，才走上几十步，整个人便显得疲累不堪，以至于跟随侍卫走下殿阶时，还需要侍卫搀扶，众人心中顿生一种悲怆之情，不少人都低头不忍再看。
趁此机会，王允又禀告天子，下令追责，将那些进入过董卓幕府，而又没有参与反董事宜的朝臣，一并革职问罪。而后又多拔擢被董卓罢黜的原袁氏掾吏，以表明自己对董卓旧党绝不姑息的态度。
当夜，太尉马日磾前往司徒府上，对王允劝说：“人非圣贤，孰能无过呢？司徒这样苛求同僚，只会让人人自危，人心沦丧，这又是何苦呢？即便如此，也不能在朝上直接逮捕蔡公啊！蔡公文坛领袖，士人仰慕，怎能如此处理？又有陈庭坚为亲，司徒如此处理，是想与并州结仇吗”
王允听得大不耐烦，看在马日磾也算是与他长久共过患难的情面上，他只是微作斥责道：“翁叔怎么也说这种话？蔡伯喈若非文坛领袖，我还真不会如此处置，文坛领袖，天下楷模，竟心怀董贼之旧恩，天下人当如何看待我等？刑乱国用重典，我必杀其以正天下！君勿复多言！”
到次日，又有大量士人上表求情，希望王允能够暂缓对昨日朝臣的处置，最少也要从轻发落。而蔡邕自己也上表道歉，希望暂受黥首刖足之刑，以续汉史，修史功成之后，再受死刑不迟。其中又有钟繇上书说：“蔡邕与陈冲有亲，司徒杀之，恐结仇于并州。”王允受此压力，这才略有转意，但他对于其余人等，就说不上仁慈了。
即不将书表全部驳回，也不公开处刑，但蔡邕还是下定决心，继续将相关人等关押在诏狱之内，在狱中断绝饮食，又加以鼠虫侵害。
董卓生前常用诏狱关押犯人，入狱之人多达百计，但多还能在狱中生活数月，政变之后，生还者十之八九。
而在王允治下，未过五日，除去蔡邕外，还有二十七名董卓幕僚入狱，皆死于狱中。
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